For omkring 100.000 år siden ophørte den vulkanske aktivitet, og vand,strømmede fra underjordiske kilder og fyldte sammen med regnvand bassinet, hvorved søen tog sin begyndelse. Mange tusind år senere var søen væsentligt større, end vi kan forestille. Vandstanden nåede næsten op til kanten af krateret hvor bjerget Monte Venere (venusbjerget), der stod som en halvø i den nordøstlige flade af søen. Sådan var det i mange årtusinder, indtil mennesket begynder at ændre dens udseende. Først etruskerne, og århundreder efter igangsatte Farneserne arbejdet med at sænke søens niveau. Gennem en kunstig udgravet stenkiste,blev vandstanden sænket med omkring 20 meter. Om det virkelig var etruskerne, eller arbejdet blev påbegyndt af romerne, vides ikke, men det er sikkert, at søens niveau blev sænket, inden byggeriet af vejen kendt som Cassia Cimini, fandt sted i kejserrigets periode. Det var derefter Farnese, omkring 1500, der genoprettede den nuværende kanal, Rio Vicano, der yderligere sænkede søens niveau med tre meter.
Den sænkede vandstanden venstre gav en betydelig udvidelse af agerjord, hvor små samfund af landbrugere og hyrder slog sig ned. I dag dækker søen et areal på cirka 12 kvadratkilometer, hvor byen Caprarola er en del af Natur Reservatet. Søen har en omkreds på 18 km, en gennemsnitlig dybde på 22,2 meter og 49,5 meters dybde hvor den er dybest. For at bevare søens økosystem er brugen af fartøjer, der drives af forbrændingsmotorer forbudt, da det forurener vandet og dens afløb.